Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2021 году»

275

Результаты оценки серопревалентности к возбудителям коклюша и дифтерии

среди медицинских работников, детей, подростков свидетельствуют о необходимости

ревакцинация взрослых старше 60 лет против коклюша и дифтерии в связи со снижением

напряженности коллективного иммунитета и повышением риска тяжелого и

осложненного течения инфекций в этой возрастной группе.

Отмечено, что причиной сохраняющегося высокого уровня серонегативных лиц

к возбудителю дифтерии среди лиц старше 60 лет является отсутствие плана ежегодной

иммунизации старших возрастных групп.

Впервые в России идентифицированы нетоксигенные штаммы

Corynebacterium

diphtheriae

subsp. lausannense, несущие ген dtxR. Учитывая, что ген dtxR регулирует

экспрессию дифтерийного токсина у токсигенных штаммов

C. diphtheriae

, нельзя

исключить, что среди данного подвида могут быть обнаружены и токсигенные штаммы,

вызывающие заболевание, подобное дифтерии. На основании установления

специфических генетических локусов сконструированы праймеры для дифференциации

подвидов

C. diphtheriae

subsp. lausannense и

C. diphtheriae

subsp. diphtheriae в ПЦР.

Разработана методика биохимической идентификации

C. diphtheriae

subsp. lausannense

по способности сбраживать N

aцетилглюкозамин.

4. Инфекции, вызываемые менингококком и пневмококком. Впервые c помощью

полногеномного секвенирования показано, что в России циркулируют определенные

генотипы менингококка, которые могут быть опасны в плане эпидемического

распространения. Так, эпидемический потенциал имеют штаммы серогруппы А

клонального комплекса (сс) 1, сиквенс

типа (ST) 75 с фенотипической формулой A:P1.5

2,10:F3-5:ST-

75(cc1). Эти штаммы явились причиной вспышки менингококковой

инфекции в 2019 году в г. Новосибирске. Среди штаммов серогруппы W cc11 выделено

подсемейство «хадж

штамма», который связан с крупной вспышкой в 2000 г. в Мекке во

время хаджа и определен как гипервирулентный и наиболее опасный.

Циркуляция потенциально опасных штаммов менингококка разных серогруп

диктует необходимость использования многокомпонентных полисахаридных, в том

числе коньюгированных, менингококковых вакцин (против серогрупп А, С, W, Y).

Вакцинные препараты против серогруппы В на сегодняшний день не

зарегистрированы в Российской Федерации. Между тем в мире используют 2 белковые

вакцины: Bexsero (4CMenB) и Trumenba (rLP2086). Впервые

на основании

полногеномных данных о российских штаммах менингококка серогруппы В и индекса

MenDeVAR

, установлено, что 50

изученных штаммов покрывались одной из двух

или обеими В

вакцинами. Это позволяет рекомендовать регистрацию В

вакцин в России.

Установлено, что в течение 2006

-2021

гг. носительство менингококка

серогруппы

А являлось существенным резервуаром возбудителя менингококковой

инфекции в г.

Москве, что указывает на целесообразность разработки

профилактического средства, препятствующего инфицированию менингококком. Таким

средством может явиться мукозальная вакцина на основе пробиотического штамма,

экспрессирующего иммуногенные белки менингококка. Впервые показана возможность

встраивания в структуру генома пробиотического штамма Enterococcus faecium L3 генов

белков менингококка NadA и FHbp (первый обеспечивает адгезию менингококка, второй

связывает фактор Н комплемента).

Проанализированы результаты полногеномного секвенирования 179 штаммов

пневмококка, выделенных на территории России в 2011

–2018

гг. Определена

принадлежность штаммов к серотипам, клональным комплексам и глобальным

генетическим кластерам (42 серотипа, 48 клональных комплексов и 14 отдельных

сиквенс

типов, входящих в 60 глобальных кластеров). Выявлены превалирующие

кластеры, ассоциированные со множественной устойчивостью (МЛУ), определены

https://pubmlst.org/bigsdb?db=pubmlst_neisseria_mendevar

276

генетические механизмы ее формирования. Установлено, что штаммы, выделенные от

больных пневмококковым менингитом кластеров GPSC6(CC156 (Spain9V

3/SLV) и

GPSC47(CC386)), экспрессировали серотипы как входящие в пневмококковую вакцину

ПКВ13, так и «невакцинные» серотипы и обладали МЛУ, что указывает на

потенциальную способность этих линий адаптироваться к селективному давлению

вакцинации и анбиотикотерапии. Полученные данные необходимы для прогнозирования

развития эпидемиологической ситуации и оценки результативности вакцинации против

пневмококковой инфекции.

Ротавирусная инфекция. Продемонстрировано положительное влияние

массовой вакцинации детей первого года жизни против ротавирусной инфекции (РВИ)

на снижение заболеваемости ротавирусным гастроэнтеритом детей возрасте до 6 лет.

Доказана безопасность массового использования вакцины в рамках регионального

календаря профилактических прививок. Плановая вакцинация против РВИ не повлияла

на «фоновый» уровень заболеваемости кишечными инвагинациями у детей.

Рекомендовано внедрить в национальный календарь профилактических прививок

вакцинопрофилактику ротавирусной инфекции с охватом не менее 90

детей

Научно-методическое обеспечение эпидемиологического надзора

за гриппом и другими острыми респираторными вирусными инфекциями

Проведенные научные исследования показали, что в мае 2021 года выявлены

первые завозные случаи гриппа A(H3N2), относящиеся к кластеру 3C.2А1b+T131K

A/159N, гомология которого по гену гемагглютинина (НА) с вакцинным штаммом сезона

2020-

2021 гг. A/Hong Kong/2671/2019 составила 97,3

Активная циркуляция вирусов гриппа, начавшаяся с декабря 2021 года,

характеризовалась преобладанием вируса гриппа A(H3N2) и единичными находками

вируса гриппа В. Циркулировавшие в 2021

г. вирусы гриппа A(H3N2) относятся к

генетической группе Бангладеш

подобных вирусов, подгруппе 3C.2a1b+T131K

-A.

Гомология гена НА вирусов гриппа A(H3N2) с включённым в состав вакцины сезона

2021–

2022 гг. для северного полушария штаммом (A/Cambodia/e0826360/2020, клайд

A1b/186S) составила 98,1

-98,9 %

, по гену нейраминидазы

– 99,1-99,3 %.

Циркулировавшие в эпидсезоне 2020

–2021

гг. вирусы гриппа A(H3N

чувствительны к ингибиторам нейраминидазы, при этом все они имеют мутации,

снижающие чувствительность к ремантадину.

Вирусы гриппа B, циркулировавшие в сезоне 2020

–2021

гг., относились к линии

«Виктория» антигенной группы 1A.3. Их гомология с вакцинным штаммом

(B/Washington/02/2019, антигенная группа 1A.3.) по гену НА составила 98,8

Впервые проведено масштабное исследование распространенности возбудителей

ОРВИ у лиц без симптомов ОРВИ. За 2021 год обследовано 189

066 человек.

Распространенность основных возбудителей в совокупности (ОРВИ, гриппа и COVID

19) составила 6,5

среди обследованных лиц, при этом превалировали риновирусы (у

3,14 %

лиц), остальные возбудители встречались менее чем у 1

лиц.

Ситуация по высокопатогенному вирусу гриппа остается напряжённой. Вспышки

среди дикой и домашней птицы регистрировались в республике Северная Осетия

–

Алания, Краснодарском крае, Астраханской и Тюменской областях. Вспышки вызваны

вирусом гриппа подтипа H5N8, H5N1, H5N5. Изучены биологические свойства

выделенных штаммов A/H5N8, А/H5N1, А/H5N5 подтипов. Штаммы H5N8

подтипа

являются высокопатогенными, относятся к генетическому кладу 2.3.4.4b, антигенно и

генетически соответствуют предложенному ВОЗ кандидатному вакцинному штамму

A/Astrakhan/3212/2020 (H5N8).

Установлено, что в организованных коллективах Свердловской области с

высоким охватом вакцинацией от гриппа в развитии заболеваемости ОРВИ ведущая роль

277

принадлежит аденовирусам и риновирусам. В сезон пандемии SARS

-CoV-2

отсутствовала активная циркуляция гриппа А(H1N1) pdm09, А(H3N2), выявлен вирус

гриппа В

– 0,2 %

, негриппозные вирусы в 55,1

. Доля респираторных вирусов (в

основном это метапневмовирусы, риновирусы, парагриппп, реже

–

бокавирусы,

аденовирусы, коронавирусы сезонные, риносинцитиальный вирус) в этиологической

структуре тяжелых форм составила 70,1

, доля вирусов гриппа

– 0,5 % (B Victoria).

Доказана высокая эффективность вакцинации против гриппа у детей школьного возраста

(67,6 %

). Риск развития тяжелой формы ОРВИ среди непривитых детей был существенно

выше, чем среди привитых (ОШ=3,087).

Научно-методическое обеспечение профилактики вирусных гепатитов

Проведён сероэпидемиологический анализ напряжённости поствакцинального

иммунитета против вирусного гепатита В (ГВ). При исследовании 408 образцов крови

протективные антитела к поверхностному антигену (анти

HBs) вируса ГВ (ВГВ)

обнаружены у 81,8

лиц.

Выявлены изоляты ВГВ субгенотипа D4, серотипа ayw2, с высокой частотой

естественных полиморфных вариантов гена Pol (РНК

зависимой ДНК полимеразы).

Филогенетический анализ полноразмерного генома ВГВ показал, что изоляты

сгруппированы вместе с изолятом субгенотипа D4 из Южной Африки.

Разработан способ выявления ДНК ВГВ в периферической крови при низкой

вирусной нагрузке с помощью ПЦР

РВ (в реальном времени), оценена его значимость

при идентификации HBsAg

негативного ГВ. Показана возможность перинатальной

передачи ВГВ ребёнку от матери с HBsAg

негативной формой заболевания.

Анализ полиморфизма гена альфа

субъединицы рецептора интерферонов 1 типа

выявил генотипы ВГВ, ассоциированные с риском развития острой хронической

печёночной недостаточности и гепатоцеллюлярной карциномы.

Определены мутации лекарственной устойчивости вируса гепатита С (ВГС) в

регионах генов NS3, NS5A, NS5B у больных хроническим гепатитом С (ХГС) генотипа

1b с неэффективностью терапии препаратами прямого противовирусного действия

(ПППД).

Значительная распространённость хронического ХГВ и ХГС в популяции

больных на заместительной почечной терапии требует оптимизации мер диагностики,

лечения, профилактики, в частности, расширения объёмов ПЦР

тестирования,

назначения ПППД у больных ХГС. В многоцентровом анализе установлена высокая

эффективность и хороший профиль безопасности ПППД у больных ХГС, получающих

лечение гемодиализом (комбинация глекапревира и пибрентасвира, применяемая в

разных центрах гемодиализа России). Использование данных препаратов является

фактором снижения риска инфицирования новых больных, а также позволяет увеличить

продолжительность и качество жизни этих пациентов.

Научно-методическое обеспечение профилактики

инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (ИСМП)

Показаны особенности течения эпидпроцесса ИСМП и факторы риска

формирования и развития инфекций области хирургического вмешательства (ИОХВ),

инфекций нижних дыхательных путей (ИНДП), катетер

ассоциированных инфекций

кровотока (КАИК). В период пандемического распространения COVID

19 отмечено

пятикратное увеличение количества зарегистрированных случаев ИСМП, из них 62

связанных с исполнением служебных обязанностей персоналом медицинских

организаций. Разработаны параметры, позволяющие своевременно выявлять факторы

риска возникновения и распространения ИСМП в стационарах различного профиля в

рамках существующей системы эпиднадзора. Даны рекомендации по

278

совершенствованию и внедрению модели риск

ориентированного эпиднадзора и

профилактики ИСМП в стационарах различного профиля, что позволит наиболее

полно идентифицировать выявляемые риски и снизить количество случаев ИСМП.

Изучены ключевые вопросы ИСМП в учреждениях родовспоможения. Показана

целесообразность применения риск

ориентированного подхода, основанного на

системно организованной эпиддиагностике, необходимость своевременного выявления

групп и факторов риска, как в разрезе отдельных подразделений, так в

родовспомогательном учреждении в целом, с целью разработки эффективных

профилактических и противоэпидемических мероприятий.

Изучены проблемы, связанные с нарастанием антибиотикорезистентности,

нерациональным применением антимикробных препаратов (АМП), необоснованным

спросом на них в условиях пандемического распространения COVID

19. Показан подъём

немотивированного уровня спроса на АМП и превышение максимальных недельных

объёмов продаж АМП практически на 50

Внедрение надзора за потреблением АМП между странами и внутри стран

позволит выявить меняющиеся тенденции в их применении, объединить усилия для

решения проблем, связанных с зависимостью медицины от применения АМП и

нерациональным использованием АМП.

Среди клинических изолятов бактерий, выделенных от пациентов

многопрофильных стационаров г.

Нижнего Новгорода, выявлена устойчивость к

цефокситину

метициллинрезистентных

штаммов

коагулазонегативных

стафилококков, обусловленная наличием гена mecA в 19,1

, гиперпродукцией

пенициллиназы

–

в 39,3

, одновременным действием данных механизмов

–

в 38,2

случаев. Установлен значительный уровень антибиотикорезистентности выделенных

штаммов клебсиелл. Выявлены штаммы

Klebsiella pneumoniae

Staphylococcus aureus

со

сверхвысоким уровнем биопленкообразования. При помощи программной обработки

полученных методом люминесцентной микроскопии изображений визуализирована

трехмерная

структура

биопленки.

Разработан

новый

оптимизированный

фотометрический способ оценки состава бактериальной биопленки.

Получена детальная молекулярно

генетическая характеристика, включающая

определение генотиповой принадлежности,

генов антибиотикорезистентности и

патогенности эпидемически значимых мультирезистентных штаммов

Klebsiella

pneumoniae

–

возбудителей ИСМП и

Mycoplasma hominis

, ассоциированных с

инфекциями мочевыводящих путей и органов репродукции. Впервые охарактеризованы

гены, кодирующие белки семейства эффлюксной системы МАТЕ

M. hominis

. Получены

новые данные о популяционной структуре

M. hominis

и карбапенем

устойчивых

штаммов

K. pneumoniae

, дана оценка участия альтернативных механизмов в

формировании множественной лекарственной устойчивости.

Изучена контаминация объектов больничной среды отделения реанимации и

интенсивной терапии (ОРИТ) инфекционного госпиталя г. Екатеринбурга для лечения

больных с COVID

19. На поверхностях обнаружены участки РНК SARS

-CoV-2

геноварианта B.1.617.1 DELTA. Среди условно

патогенных микроорганизмов (УПМ)

преобладают

Enterococcus faecalis

Klebsiella pneumoniaе

Escherichia coli

. В единичных

случаях выделены

Enterococcus faecium

Staphylococcus aureus

Pantoea agglomerans

. Ряд микроорганизмов продемонстрировал высокий уровень

резистентности к АМП. Установлены наиболее контаминированные объекты

больничной среды ОРИТ: наружная поверхность медицинского оборудования,

контактные поверхности помещений, наружная поверхность средств индивидуальной

защиты и перчаток персонала.

Оценена потенциальная опасность больничной среды двух инфекционных ЛПУ

г.

Хабаровска, развернутых в период пандемии новой коронавирусной инфекции.

279

Патогенные биологические агенты (ПБА, 9 наименований) выделены в 4,7

смывов и в

6,6 %

проб воздуха, при этом лекарственно устойчивые микроорганизмы

идентифицированы в 50

контаминированных образцов. Выявленная циркуляция

большого перечня микроорганизмов во внешней среде двух стационаров обеспечивает

высокий риск заражения пациентов из больничной среды.

Обоснована необходимость создания системы эпидемиологической безопасности

ультразвуковой диагностики, определены основные ее компоненты и нормированы

требования к ним.

Выявлены особенности течения COVID

19, прогностические факторы, связанные

с фатальным исходом у больных, с терминальной стадией хронической болезни почек,

получавших лечение програмным гемодиализом. Предикторами неблагоприятного

исхода являются высокий индекс коморбидности, распространенность поражения

легких (степень 3

4 по данным КТ) и необходимость применения ИВЛ. Назначение

блокаторов рецепторов ИЛ

6 или их комбинации с кортикостероидами, раннее начало

лечения моноклональными антителами к рецепторам ИЛ

6 у больных с небольшой

площадью поражения легких (КТ 1

2) позволило снизить летальность в этой популяции

с 31,2

до 15,1

, то есть в 2 раза.

Научно-методическое обеспечение эпидемиологического надзора

за энтеровируснымии инфекциями

Территории Санкт

Петербургского регионального центра по надзору за

полиомиелитом и острыми вялыми параличами (СПб РЦ) сохраняют свободный от

полиомиелита статус, что является принципиально важным доказательством прогресса

на пути

его

ликвидации в глобальном масштабе. Показано разнообразие типов

неполиомиелитных энтеровирусов, циркулирующих на территориях СПб РЦ, доля

которых в структуре выделенных вирусов меняется в разные годы на разных

территориях. Секвенирован участк генома VP1 23 штаммов энтеровирусов Коксаки А10

и 2 штаммов Коксаки А2.

Охарактеризована типовая структура возбудителей энтеровирусной инфекции в

Российской Федерации в 2021 г., представленная вирусами 38 типов. Установлено, что

рост числа случаев ЭВИ, в значительной степени, связан с активизацией циркуляции и

распространением вирусов вида Энтеровирус А, в первую очередь, вирусов Коксаки А6,

Коксаки А2, Коксаки А4, которые способны эффективно реализовывать аспирационный

механизм передачи и вызывать респираторные и экзантемные заболевания. Установлена

генетическая неоднородность российских штаммов вируса Коксаки А6, проявившаяся в

одновременной циркуляции, как на территории РФ в целом, так и в отдельных субъектах,

вирусов, принадлежащих нескольким субгенотипам или геновариантам, различным по

происхождению. Ежегодно в циркуляцию включаются вирусы, относящихся к новым,

ранее не встречавшимся в России, геновариантам вируса Коксаки А6. Большинство

идентифицированных в 2021

г. штаммов вируса Коксаки А6 генетически далеки от

вирусов, циркулировавших в прежние годы, и проявляют близкое родство с

зарубежными изолятами.

С целью повышения информативности филогенетического анализа штаммов

Коксаки А10 разработан набор олигонуклеотидных праймеров для получения полной

нуклеотидной последовательности гена VРI энтеровируса Коксаки А10.

Научно-методическое обеспечение профилактики

инфекций желудочно-кишечного тракта

Ротавирусная и норовирусная инфекции.

Проведенными исследованиями показано

превалирование в циркуляции на территории Российской Федерации (Московская,

Томская, Нижегородская, Иркутская, Свердловская, Новосибирская области, Республика

280

Дагестан, Хабаровский Край, Камчатский Край) генотипа ротавирусов G9P[8]

– 31,4 %.

Другие антигенные типы встречались со следующими частотами:

G3P[8] – 27,0 %, G1P[8] –

15,9 %, G2P[4] – 13,0 %, G4P[8] – 1,4 %

. Доминирующий генотип G9P[8], вариабельный на

уровне нуклеотидной и аминокислотной последовательностей VP7, относится к

филогенетическим линиям G9

-III, G9-

VI, выявленным в ассоциации с разными аллелями

гена VP4. Сохраняется циркуляция двойных DS

-1-

подобных реассортантов, среди

которых распространены штаммы генотипов G3P[8], G8P[8]. Выявлен ранее не

обнаруживаемый генотип G12P[6].

В циркуляции норовирусов превалирует генотип GII.2GII.P16. Второй по

распространённости генотип

–

GII.P17/GII.17. При спорадической заболеваемости

сохраняются генотипы GII.P12/GII.3, GII.P16/GII.4 Sydney 2012.

В Приволжком федеральном округе

(

ПФО

)

спектр норовирусов включает 9

различных генотипов, доминирует рекомбинантный

норовирус GII.3[P12].

Доминировавший ранее вариант GII.4 Sydney представлен рекомбинантами с тремя

различными типами гена РНК

полимеразы.

В Дальневосточном федеральном округе (ДФО

)

ежегодно растёт заболеваемость

норовирусной инфекцией. Выявлены генотипы норовирусов: GII.17, GII.2,

GII.3, GII.4,

GII.7, GII.12, GII.6. Групповая заболеваемость связана с генотипами, имеющими

глобальное распространение в мире. При вспышках норовирусной инфекции в

г.

Хабаровске выявляется генотип GII.6. в Еврейской автономной области и Амурской

области одновременно циркулирует генотип GII.3. При спорадической заболеваемости

среди детей превалирует генотип GII.4 Sydney_2012.

Продемонстрировано положительное влияние массовой вакцинации детей

первого года жизни против ротавирусной инфекции (РВИ) на снижение заболеваемости

ротавирусным гастроэнтеритом детей возрасте до 6 лет. Доказана безопасность

массового использования вакцины в рамках регионального календаря профилактических

прививок. Плановая вакцинация против РВИ не повлияла на «фоновый» уровень

заболеваемости кишечными инвагинациями у детей. Рекомендовано внедрить в

национальный календарь профилактических прививок вакцинопрофилактику

ротавирусной инфекции с охватом не менее 90

детей

Сальмонеллезы.

Изучена чувствительность к 24

антибиотикам у изолятов

сальмонелл, выделенных при случаях групповой заболеваемости и объектов

окружающей среды. Сальмонеллы чувствительны к нетилмицину, амикацину,

тигециклину,

цефазолину,

цефоперазону,

меропенему,

эртапенему;

доля

полирезистентных изолятов

Salmonella enterica

subsp. enterica снижается.

Впервые в мире обнаружены колистинрезистентные изоляты S. Enteritidis

ассоциированные со вспышкой сальмонеллёза. Ген резистентности mcr

1.1 локализован

на конъюгативной плазмиде IncX4.

На основе полногеномного секвенирования усовершенствованы алгоритмы

субвидовой генетической характеристики изолятов

Salmonella enterica

subsp. enterica,

внедренные в практику анализа случаев групповой заболеваемости сальмонеллезами.

Установлена возможность коинфекцирования больных разными плазмидными

типами сальмонелл и сероваров S. enterica и развитие суперинфеции в стационаре.

Хеликобактерная инфекция.

С целью прогнозирования ответа на ингибиторы

протонной помпы и персонализированного подхода к лечению пациентов с

хеликобактерной инфекцией обосновано применение фармакологического тестирования

по выявлению у пациентов генетических полиморфизмов цитохрома Р 450 CYP2C19,

влияющих на частоту эрадикации

Helicobacter pylori

, метаболизм ингибиторов

протонной помпы и эффективность их

применения. Установлено, что среди россиян

преобладают быстрые и промежуточные метаболизаторы.

281

Исследование биопсий слизистой оболочки желудка выявило у пациентов с

H. pylori

ассоциированным гастритом значительное увеличение содержания и усиление

провоспалительных свойств Т

лимфоцитов хелперов, несущих рецептор CCR6. При

этом они не только осуществляют направленную миграцию в слизистую воспаленного

желудка, но и реализуют этот тип миграции в условиях

in vivo

, что свидетельствует об

участии Т

хелперов CCR6+

в патогенезе хеликобактерной инфекции и открывает

возможности поиска новых средств таргетной терапии.

Обосновано применение математического моделирования при оценке состояния

микробиома человека с помощью газовой хроматографии

масспектрометрии. Такой

подход нацелен на экспресс

диагностику, оценку прогноза и эффективности лечения при

ОКИ, хеликобактерной инфекции, криптоспоридиоза.

Псевдотуберкулез.

Генетически

охарактеризованы

штаммы

Yersinia

pseudotuberculosis

по содержанию генов факторов патогенности, обусловливающих

полиморфизм клинической картины псевдотуберкулёза. Обнаружены штаммы редкого

для Российской Федерации генотипа, характеризующегося отсутствием гена

суперантигена и плазмиды рVM82 при наличии генов «острова высокой патогенности»

HPI+YAPI-YPM-

рVM82

. Обнаружение штаммов

Y. pseudotuberculosis

генетической

подгруппы 2a, вызывающих заболевание, протекающее в виде гастроэнтерита с

лихорадкой и развитием мезентериального лимфаденита, обосновывает необходимость

обследования на псевдотуберкулез больных с проявлениями ОКИ неустановленной

этиологии. Показано, что 98

штаммов

Y. pseudotuberculosis

чувствительны к

тетрациклинам

лактамам, аминогликозидам, амфениколам, фторхинолонам.

Реверсия некультивируемых клеток

Y. pseudotuberculosis

, индуцирующих

развитие псевдотуберкулезной инфекции в теплокровном организме, доказывает

эпидемиологическое значение некультивируемых фенотипов патогенных бактерий,

длительно находящихся в природных экосистемах в неблагоприятных условиях.

Возбудители

Y. pseudotuberculosis

могут существовать на каллусах культурных и

лечебный растений, используемых в качестве фармацевтического сырья

сохраняют

патогенный потенциал в условиях морской экосистемы.

В природных очагах кишечного иерсиниоза Иркутской области методом ПЦР

выявлена ДНК

Y. enterocolitica

у мелких млекопитающих. Обнаружены антитела к

еnterocolitica

3 у людей. Заболеваемость иерсиниозами сохраняется в пределах

многолетних показателей. Возможно возникновение локальных эпидемических

вспышек в детских организованных

коллективах, что обуславливает необходимость

систематического проведения мероприятий, включающих эпизоотологическое

обследование, регулярный мониторинг эпидемиологически значимых объектов на

Y. pseudotuberculosis

и патогенные

Y. enterocolitica

Научно-методическое обеспечение эпидемиологического надзора

за социально значимыми инфекциями

ВИЧ-инфекция.

Отработана методология комплексной оценки и моделирования

социально

экономических последствий эпидемии ВИЧ

инфекции. Объем расходов

бюджетов субъектов России

на реализацию мер по противодействию ВИЧ

инфекции

вырос в 3,1 раза. Распространение ВИЧ/СПИДа может привести к значительным

демографическим потерям. Увеличение охвата антиретровирусной терапией (АРТ)

людей, живущих с ВИЧ (ЛЖВ) до 90

от их оценочного числа, позволит сохранить к

2050 году более 1 млн

жизней и сократить экономическое бремя ВИЧ

инфекции.

Изучены связанные с ВИЧ

инфекцией заболевания и их влияние на

болезненность и смертность ЛЖВ. Когнитивные нарушения выявлены у 76,8

ЛЖВ.

Получены данные о

распространённости COVID

19 среди ЛЖВ, изучено сочетанное

течение ВИЧ и COVID

-19.

282

Использование разработанных принципов организации исследований и порядка

использования генотипирования и филогенетического анализа ВИЧ и вируса гепатита С

будет способствовать повышению эффективности эпидрасследования случаев ВИЧ

инфекции и гепатита С.

Российские штаммы ВИЧ

1 обладают высоким генетическим разнообразием. В

России и странах постсоветского пространства доминирует суб

субтип А6 ВИЧ

1, реже

обнаружены субтип B, CR

F63_02A1, CRF02_AG.

В Сибирском федеральном округе

(

СФО

)

доля суб

субтипа А6 ниже, доля CRF63_02A1 выше; для Уральского

федерального округа (УФО

)

доля CRF03_AB выше, чем в среднем по стране.

Наибольшее разнообразие генетических вариантов ВИЧ

1 зарегистрировано в

Центральном федеральном округе (ЦФО

Среди пациентов без опыта АРТ резистентность к антиретровирусным

препаратам (АРВП)

– 12,5 %

. Наиболее часто резистентность обнаружена к

ненуклеозидным ингибиторам обратной транскриптазы (ННИОТ), реже к ингибиторам

интегразы, нуклеозидным ингибиторам обратной транскриптазы, ингибиторам протеазы

(ИИ, НИОТ, ИП). Среди пациентов с опытом АРТ резистентность к

АРВП

– 82,4 %,

наиболее часто к НИОТ, ННИОТ, реже к ИИ, ИП. Прослеживается рост лекарственной

устойчивости (ЛУ) к НИОТ, ННИОТ.

Охват скринингом граждан на антитела к ВИЧ снизился как в целом по

Российской Федерации, так и на территориях СЗФО

среди беременных женщин и в

уязвимых группах. У ВИЧ

пациентов с неэффективностью АРТ преобладает субсубтип

A6, в единичных случаях обнаружены субтип В и рекомбинант между циркулирующей

рекомбинантной формой CRF_03AB и субсубтипом А1; выявлены мутации,

ассоциированные с

ЛУ. Большинство мутаций вызывают резистентность к НИОТ

меньшинство

–

устойчивость к ИП.

Показано, что риск неэффективности АРТ может быть связан с полиморфизмами

делеций генов первой фазы биотрансформации ксенобиотиков GSTM1 и GSTT1 у

пациентов с ВИЧ

инфекцией. Риск неэффективности АРТ установлен для лиц с

комбинированным генотипом GSTM1 0/0 + GSTT1 0/0.

Установлены эпидемиологические особенности ВИЧ

инфекции в СФО:

преобладание неработающих лиц мужского пола 30

–

39 лет среди вновь выявленных

ВИЧ

инфицированных; преимущественно половой путь передачи, высокий уровень ко

инфекции с туберкулёзом или гепатитом С; доминирование среди причин смерти

прогрессирования ВИЧ

инфекции; средний уровень приверженности пациентов к АРТ,

высокий уровень мутаций ВИЧ, ассоциированных с ЛУ.

В ДФО распространены субтипы С и В ВИЧ

1. Зарегистрированы

рекомбинантные вирусы URFA/C, возникшие на основе специфических для России ВИЧ

субтипа А и дальневосточного варианта субтипа С. Выявлен завозной случай ВИЧ

-1

CRF01_AE, характерный для Таиланда и Вьетнама.

В УФО доминирует субтип A6 ВИЧ

1, субтип B выявлен в 2,69

случаев,

рекомбинантные формы ВИЧ

-1 –

в 6,28

. Наиболее распространенными мутациями ЛУ

являются M184V и G190S. Распространённость ЛУ среди пациентов с

неэффективностью АРТ составляет 60,1

, резистентность высокого уровня выявлена в

56,5 %

случаев. Результаты филогенетического анализа консервативного гена pol

свидетельствуют об активном заносе инфекции из других стран.

Особенности эпидситуации по ВИЧ

инфекции в ПФО: рост показателя

заболеваемости, положительный темп прироста числа новых случаев инфицирования и

числа выявленных инфицированных лиц старше 40 лет; преобладание полового пути

передачи; снижение инфицирования при парентеральном употреблении психоактивных

веществ; рост показателя смертности; увеличение объёма тестирования населения на

ВИЧ

инфекцию, в том числе лиц с высоким риском инфицирования; снижение доли

283

обследуемых лиц, отнесенных к категории «недифференцированного» населения;

сохранение высокого процента лиц, среди которых не проведено эпидемиологическое

расследование; рост числа детей, инфицированных при перинатальном контакте с ВИЧ.

Выявлены штаммы ВИЧ с мутациями ЛУ к НИОТ, ННИОТ, ингибиторам

обратной транскриптазы (ОТ) и ИП. Множественная лекарственная устойчивость (МЛУ)

отмечена к НИОТ и ННИОТ. Выявлены мутации ЛУ у лиц, получавших ИИ.

Многократная замена препаратов класса ИИ в схемах АРТ ведет к возникновению и

накоплению мутаций ЛУ даже к таким эффективным препаратам, как ИИ.

В Сахалинской области и Республике Саха (Якутия) доминирует геновариант

IDU-

A, выявлены рекомбинантные формы ВИЧ

1: CRF02_AG, CRF63_02A1. Причиной

распространения рекомбинантных форм ВИЧ

1 может быть высокий уровень

внутренней и внешней миграции. В структуре мутаций доминируют мутации ЛУ к

НИОТ и ННИОТ. Штаммы ВИЧ с МЛУ к двум или более классам АРВП выявлены в

64,0 %

случаев. В гене обратной транскриптазы ВИЧ

1 наиболее распространены

мутации ЛУ M184V, G190A/S, K103N, в гене протеазы

– M46I.

Таким образом, в Российской Федерации продолжается формирование

резистентных форм ВИЧ

1, что приводит к неэффективности АРТ. Этому способствует

рост числа больных ВИЧ

инфекцией, длительно получающих и допускающих перерывы

в АРТ.

Туберкулез.

Показана более высокая чувствительность пробы Манту по

сравнению с Диаскинтестом при скрининге с целью раннего выявления случаев

активного и неактивного туберкулеза у детей.

Получены данные о генотипах и фенотипах MDR/XDR

российских штаммов

Mycobacterium tuberculosis

, относящихся к современным генетическим линиям.

В Архангельской области доминируют штаммы M. tuberculosis Beijing.

Установлена его связь с ЛУ и МЛУ (42

и 34

штаммов соответственно).

Устойчивость к рифампицину и изониазиду обусловлена мутациями rpoB Ser531Leu,

katG Ser315Thr. Помимо генотипа Beijing, циркулируют генотипы T, Ural, Haarlem.

Среди штаммов Beijing преобладают Central

Asian/Russian и B0/W148 кластеры.

Штаммы, выделенные от пациентов с коинфекцией ВИЧ/туберкулез, принадлежат

к генотипу Beijing (84

), в том числе к кластеру Cen

tral Asian/Russian, 31 % –

к В0/W148,

9 % –

к древней сублинии Beijing. Доля штаммов Beijing древней сублинии в группе

пациентов с ВИЧ

ассоциированным туберкулезом превышает таковую в группе лиц без

ВИЧ

инфекции, что указывает на их возможную и недооцененную клиническую

значимость при коинфекции ВИЧ/туберкулез.

Научно-методическое обеспечение эпидемиологического надзора за природно-

очаговыми, зооантропонозными, особо опасными инфекциями

Санитарная охрана территории.

Расширен функционал программного

обеспечения «Интерактивная карта

мониторинг опасных инфекционных болезней на

территории Российской Федерации и стран Восточной Европы и Центральной Азии

(ВЕЦА)». Разработанная компьютерная программа предназначена для автоматизации

процессов информационного

взаимодействия эпидемиологов и лабораторных

специалистов учреждений санитарно

эпидемиологического профиля при выполнении

стандартных операционных процедур в обычном режиме функционирования.

Подготовлено справочное издание

«Распространение в мире инфекционных

болезней, значимых для обеспечения эпидемиологического благополучия

международных сообщений».

Том II. Европейский регион.

Инфекции, передающиеся клещами.

В Российской Федерации сохраняется тренд

на снижение заболеваемости инфекциями, передающимися клещами. Снижение числа

284

случаев клещевого вирусного энцефалита (КВЭ) может быть объяснено наряду с

природными факторами введением ограничительных мер во время эпидемии COVID

-19.

Проведен серологический мониторинг напряженности иммунитета населения

Республики Татарстан к возбудителям гемморрагической лихорадки с почечным

синдромом (ГЛПС), лихорадки Западного Нила (ЛЗН) и инфекций, передающихся

клещами

–

иксодового клещевого боррелиоза (ИКБ), КВЭ, моноцитарного эрлихоза

человека

(МЭЧ), граноцитарного анаплазмоза человека (ГАЧ). Несмотря на отсутствие

зарегистрированных случаев ГЛПС, ИКБ и КВЭ, данные серомониторинга указывают на

скрыто протекающий эпидпроцесс в ряде районов за счет бессимптомного носительства

и легких форм заболеваний. В ряде районов инфицированность населения

возбудителями ЛЗН, МЭЧ, ГАЧ достаточно высока, что свидетельствует об

интенсивности скрыто протекающего эпидпроцесса.

Выявлено

инфицирование возбудителями клещевых риккетсиозов 14,7

иксодовых клещей Dermacentor reticulatus, собранных в рекреационной зоне г. Омска.

Выявлена ДНК

Rikettsia sibirica

, что указывает на существование природных очагов и их

потенциальную опасность для человека.

Установлена таксономия пяти видов клещей рода Dermacentor, распространённых

на территории Евразии и являющихся переносчиками риккетсий группы клещевой

пятнистой лихорадки (КПЛ).

D. marginatus

D. silvarum

D. niveus

являются

конспецифичными представителями молодого подрода Serdjukovia. Ряд патогенных

видов риккетсий группы КПЛ передается этими видами клещей человеку на территории

Российской Федерации и Республики Казахстан.

В природных очагах Западной Сибири выявлена циркуляция

Borrelia garinii

B. afzelii

B. bavariensis

B. miyamotoi

B. spielmanii

, установлены вариабельность уровня

инфицированности клещей боррелиями, отсутствие существенных различий в уровнях

инфицированности боррелиями клещей

Ixodes persulcatus

I. рavlovskiy

и в частоте

обнаружения в них геновидов

B. garinii

B. afzelii

. Отмечена более частая встречаемость

B. garinii

по сравнению с

B. afzelii

. В клещах

D. reticulatus

выявлена ДНК B. spielmanii и

B. miyamotoi

Подтверждено значение таежного клеща

I. persulcatus

в формировании

псевдоочагов ЛЗН в лесной зоне Западной Сибири. Определен уровень

инфицированности имаго таежного клеща данным вирусом. Показана возможность

выноса возбудителя ЛЗН в популяцию кровососущих комаров с неспециализированным

типом питания.

Определена закономерная периодичность показателей инвазированности

основных групп прокормителей

I. persulcatus

I. apronophorus

, позволяющая

моделировать и прогнозировать изменения эпидемической и эпизоотической активности

природных очагов клещевых инфекций.

Показано, что в условиях массовой иммунизации населения на эндемичных по

КВЭ территориях рационально увеличение интервала между ревакцинациями с 3 до 6

лет для лиц моложе 60 лет и персонифицированный подход к ревакцинации с

предварительным определением уровня противовирусных IgG

антител.

Проведен анализ переносчиков на наличие ДНК риккетсий группы КПЛ в городе

Санкт

Петербурге. Результаты свидетельствует о генетической дистанцированности

популяции риккетсий, циркулирующих на территории г.

Санкт

Петербурга, по

сравнению с популяцией риккетсий за рубежом.

Проведен мониторинг выявляемости антител у населения к вирусу КВЭ на двух

неэндемичных территориях Республики Саха и Хабаровского края. Несмотря на

отсутствие регистрируемой заболеваемости КВЭ в Республике Саха, выявление

серопозитивных лиц к вирусу КВЭ среди не привитых вакциной ее

жителей позволяет

предположить наличие очагов КВЭ. Природные условия территории Тугуро

285

Чумиканского района Хабаровского края считаются неблагоприятными для

существования таежного клеща

I. persulcatus

–

основного переносчика вируса КВЭ на

Дальнем Востоке. Низкие показатели заболеваемости КВЭ населения на фоне высокого

уровня серопозитивности могут быть обусловлены развитием официально не

регистрируемых, бессимптомных и инаппарантных форм инфекции у жителей. Наличие

иммунной прослойки к вирусу КВЭ, выявление клещей, инфицированных возбудителем,

ежегодное увеличение числа лиц, отмечавших присасывание клеща, хозяйственное

освоение территорий может стать причиной их перехода в разряд эндемичных по КВЭ.

Для территорий Забайкальского края, Республики Бурятии, Иркутской области

выделены группы муниципальных образований с очень высокой, высокой, средней,

низкой заболеваемостью КВЭ. Для каждого выделенного кластера территорий

проанализирован риск присасывания клещей

переносчиков возбудителя к людям,

уровень специфической и неспецифической профилактики КВЭ, состояние

лабораторной базы оказания помощи людям, пострадавшим от присасывания клещей, и

изучение

этиологических агентов типичных нозоформ в переносчиках, иная

информация, характеризующая паразитарную триаду и социально

экономические

условия жизни населения. Предложены меры профилактики КВЭ для каждой группы

территорий, что должно повысить их адресность и эффективность применения.

Выявление ДНК

R. sibirica

из

D. reticulates

свидетельствует о вероятности

существования очагов

клещевого риккетсиоза в Тюменской области.

Обнаружено возрастание численности весенней и летней популяции таежных

клещей в подзоне южной подтайги, возрастание доли клещей, инфицированных

спирохетами комплекса

Borrelia sl

. и ВКЭ, что указывает на

неблагоприятную

эпидемиологическую

обстановку

по клещевым инфекциям в Западной Сибири.

Инфекции, передающиеся комарами.

Впервые в мире зарегистрирована вспышка

ЛЗН на наиболее

северной для вируса Западного Нила (ВЗН) территории

–

Москве и

Московской области. Генетическое разнообразие изолятов 2021 года позволило сделать

предположение, что вирус на данной территории циркулирует длительное время,

филогенетический анализ свидетельствует о том, что было, как минимум, три заноса

ВЗН разных генетических вариантов. Очаги вируса поддерживались в цикле комар

птица, возможно, без значительного проявления эпидемической активности и

регистрации больных людей. Вирус обнаружен среди гусей и уток. Основным

переносчиком вируса в Москве является комар

Culex pipiens

синантропной формы

molestus

. В Московском регионе необходимо изучить серопревалентность к ВЗН

жителей и осуществлять пассивный и активный эпидемиологический надзор за ЛЗН с

целью профилактики заболевания.

Показана устойчивая и расширяющаяся в границах циркуляция в Краснодарском

крае и Республике Крым комаров

Aedes albopictus

, способных к аутохтонной передаче

вирусов Зика, Денге, Чикунгунья от людей, завезших заболевание из эндемичных по

данным лихорадкам территорий.

На территории Волгоградской области обнаружен новый геновариант ВЗН

(представляет собой обособленную кладу второго генотипа ВЗН, не имеет гомологов в

международных генетических базах данных).

Проведено моделирование ЛЗН на чижах, перепелах обыкновенных, лягушках

озерных. У чижей развивалось заболевание с наличием патологических изменений в

сердце, почках, печени, стволе головного мозга. У перепелов и амфибий при отсутствии

клинических проявлений обнаружен антиген ВЗН в клоакальных мазках, наблюдалась

вирусемия, достаточная по титру вируса для заражения переносчиков при кровососании.

Перепел обыкновенный и лягушка озерная могут являться резервуарами ВЗН и играть

роль в его циркуляции.

286

В кровососущих комарах, собранных на территории Волгоградской области,

идентифицированы антигены вирусов Батаи, Бханджа, Калифорнийской серогруппы,

Синдбис, Укуниеми. В образцах крови доноров выявлены специфические

иммуноглобулины к ВЗН, Крымской геморрагической лихорадки, Калифорнийской

серогруппы и Синдбис. Подобраны праймеры для детекции РНК вируса Синдбис IV

генотипа методом ОТ

ПЦР.

Выделен неизвестный изолят, который идентифицирован как вирус озера Эбинур,

филогенетически близкий

к китайскому изоляту Ab

-BUNV Cu20-XJ.

Чума.

Проведено ландшафтное ГИС

картографирование природных очагов чумы

Российской

Федерации. Составлены крупномасштабные карты, используемые для

осуществления эпизоотологического мониторинга, прогнозирования и поиска участков

возможной активизации

эпизоотического процесса. Разработаны и зарегистрированы

Атлас Прикаспийского Северо

Западного степного природного очага чумы и Атлас

Прикаспийского песчаного природных очагов чумы, служащие основой

информационно

аналитической и картографической частей электронных паспортов этих

очагов.

Проведено комплексное исследование свойств и секвенирование 13 штаммов

Yersinia pestis

из природных очагов чумы Российской Федерации, установлена их

филогенетическая принадлежность. Создана база данных, содержащая информацию о

структурно

функциональных особенностях полного генома типичных штаммов

Y. рestis

из 11

природных очагов чумы на территории России.

Сконструирован набор праймеров для внутривидовой дифференциации штаммов

Y. pestis

. Показано, что отдельные генетические группы соответствуют биоварам

возбудителя чумы. С помощью праймеров, детектирующих последовательности IS

элементов в области гена ферредоксина в геноме

Y. pestis

, штаммы

Y. pestis

bv. antiqua

разделены на подгруппы, включающие штаммы из Африки и Средней Азии.

Разработан способ идентификации ДНК чумного и псевдотуберкулезного

микробов и дифференциации штаммов основного и центральноазиатского подвидов Y.

pestis с применением мультиплексных ПЦР.

Охарактеризована протективная активность, проведено полногеномное

секвенирование штаммов Y. pestis со сниженной вирулентностью, перспективных в

качестве кандидатов в вакцинные штаммы.

Получен очищенный рекомбинантный белок Ail чумного микроба для

исследования его протективных и иммуногенных свойств.

Разработаны методические подходы для подготовки ДНК, выделенной из

бактерий

возбудителей особо опасных инфекций с использованием технологии нанопор,

позволяющие с помощью биоинформационных программ собирать нуклеотидные

последовательности полных геномов бактерий в кольцевую последовательность полной

хромосомы и плазмид.

Сибирская язва.

Сконструирован набор праймеров для выявления

филогеографически значимых мутаций в геноме возбудителя сибирской язвы

Bacilus

anthracis

методом аллель

специфичной ПЦР.

Создана единая межведомственная База данных по сибирской язве в Приморском

крае. Установлен потенциально высокий риск заражения

Вacilus. anthracis

в девяти

западных и южных районах Приморского края.

Создана коллекция штаммов группы

Bacilus cereus

(вызывают токсикоинфекции

у человека) различного происхождения, в том числе из проб вечной мерзлоты.

Сконструированы праймеры для выявления генов синтеза энтеротоксинов и праймеры

для определения видовой принадлежности штаммов группы

В. сereus

на основе

выявления видоспецифичных мутаций гена motB.

287

Холера.

С целью обеспечения эпидемиологического благополучия по холере

определены с использованием информационных технологий тенденции в динамике

заболеваемости холерой

в мире с учетом чрезвычайных ситуаций социального и

природного происхождения. Установлено функционирование эпидпроцесса в ряде стран

Азии и Африки, наличие эндемичных территорий. Эпидемии и вспышки на всех

континентах в последнее десятилетие вызваны

Vibrio cholerae

О1 биовара Эль Тор,

сероваров Огава и Инаба, продуцирующими холерный токсин классического типа и

содержащими в основном аллели гена B

субъединицы холерного токсина ctxB1, ctxB7.

Данные о контаминации

V. cholerae

О1 поверхностных водоемов России

систематизированы с учетом типов административных территорий по эпидемическим

проявлениям холеры, федеральных округов, стационарных точек отбора проб из

поверхностных водоемов, климато

географических областей.

При анализе данных об изоляции

V. cholerae

О1 установлено, что наибольшее

число штаммов

приходится на стационарные точки, расположенные в местах

неорганизованного рекреационного водопользования. Продолжается комплексное

изучение особенностей генетической организации штаммов

V. cholerae

, в том числе

атипичных, выделяемых на территории России и сопредельных государств, структуры и

функции факторов, определяющих их патогенные и персистентные свойства

поиск

новых маркеров для идентификации и типирования.

Доказана эффективность ПЦР

скрининга генетических детерминант

V. cholerae

при мониторинге поверхностных водоемов, рекомендовано его применение в

исследованиях вибриофлоры в пробах из объектов окружающей среды. Выявлены

различия в биопленкообразовании у штаммов

V. cholerae

O1 серогруппы и R

варианта.

Туляремия.

Оптимизирована схема выделения ДНК возбудителя туляремии

Francisella tularensis

, позволяющая проводить информативное нанопоровое

секвенирование, выявлять возможные отличия в нуклеотидных последовательностях

островов патогенности

F. tularensis

Предложен способ дифференциации штаммов

F. tularensis

путем выявления пяти

общих INDEL

генов (имеющих делеции определенного размера) с последующей их

амплификацией при помощи

сконструированных специфических праймеров,

выявляющих два альтернативных аллеля.

Получены препараты везикул

F. tularensis

subsp.

holarctica 503 и

близкородственных франциселл

–

F. tularensis

subsp. novicida (-like)

. Предполагается

изучение иммуногнных и протективных свойств препаратов.

Бешенство.

Установлена роль енотовидной собаки в циркуляции вируса

бешенства, продолжается расширение ареала инфекции в северо

восточном

направлении с формированием стойких природных очагов на ранее благополучных

территориях. Определена высокая, спонтанная зараженность вирусом бешенства

популяции лисицы. Выявлена значимость рукокрылых как источника лиссавирусной

инфекции с летальными исходами у людей на юге ДФО.

Получены новые данные о генетическом разнообразии вируса бешенства,

высказано предположение о возможности выявления очага бешенства в Мариинском и

Тяжинском районах Кемеровской области. Уточнено распространение двух

генетических вариантов вируса бешенства на территории Западной Сибири. В пределах

Минусинской

котловины

распространены

изоляты,

близкородственные

циркулирующим на территориях Монголии, Китая и граничащих с ними регионов

России. В Назаровской котловине выявляются геноварианты, сходные с выделенными

на территориях Казахстана и Омской области. В Республике Алтай выявлены три

независимые филогруппы: родственная монгольским геновариантам; близкая изолятам

из Омской и Новосибирской областей; географически обширная группа, включающая

288

изоляты с территорий Омской, Новосибирской, Оренбургской, Астраханской, Тульской

областей, Казахстана.

Мелиоидоз.

Проведено разделение клеточных белков, выделенных из

бактериальной массы штаммов возбудителя мелиоидоза

Burkholderia pseudomallei

возбудителя сапа

B. mallei

B. thailandensis

в полиакриламидном геле методом

двумерного электрофореза. Выделены отдельные протеины (50 кДа, 22 кДа, 16 кДа) и

осуществлена их идентификация методом MALDI

ToF масс

спектрометрии. Белок

массой 16 кДа идентифицирован как 50S рибосомальный белок, белок массой 50 кДа

–

как дифосфатсинтаза, а массой 20 кДа

–

как фактор созревания рибосом RimP. Данные

белки являются предварительными кандидатами для определения видовых маркеров

B. pseudomallei

, обладающих иммунологической активностью.

Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС).

Установлено, что

патогенным агентом ГЛПС в природных очагах Республики Татарстан является

хантавирус генотипа Пуумала. Главным резервуаром и источником заражения человека

является полевка рыжая, наибольшая численность которой регистрируется в

репродуктивных широколиственных лесных формациях, характеризующихся высокой

кормностью и ремизностью. Показана прямая зависимость эпизоотической активности

полевки рыжей от породно

возрастного состава древостоя. Исследованы

рекомбинантные и реассортантные геномы ортохантавируса

Puumala

у больных ГЛПС,

переносчиков хантавирусной инфекции. Проанализированы участки S, M, L сегментов

генома штаммов

Puumala orthohantavirus

, циркулирующих в ряде популяций рыжей

полевки. Все штаммы PUUV относятся к генетической линии RUS.

Бруцеллез, лихорадка Ку, лептоспироз

. Связь заболевания с профессией

установлена у половины больных бруцеллезом людей.

Выявлено преобладание

хронического и резидуального бруцеллеза, что свидетельствует о необходимости

повышения качества периодических осмотров групп профессионального риска. Для

повышения мер борьбы с бруцеллезом необходим строгий контроль за соблюдением

санитарно

противоэпидемических мероприятий на мясо

промышленных предприятиях.

По результатам серо

эпидемиологического мониторинга установлено, что лица,

профессионально связанные с животными или сырьем животного происхождения

(ветеринарные специалисты и работники мясо

промышленных предприятий) на

территории Омской области

контактируют с возбудителями лихорадки Ку, бруцеллеза

и листериоза чаще, чем это отражено статистикой заболеваний.

Доказана диагностическая значимость определения авидности IgG к антигенам

возбудителя лихорадки Ку в I и II фазовых состояниях для уточнения стадии, срока

давности инфицирования, прогноза течения заболевания.

Апробированы методические подходы для определения нуклеотидных

последовательностей фрагментов генома патогенных лептоспир (возбудителей

лептоспироза) с применением фрагментного секвенирования по Сэнгеру для

верификации результатов индикации патогенов.

Научно-методическое обеспечение диагностики инфекционных болезней

Испытания и регистрация иммунобиологических препаратов для диагностики

инфекционных болезней.

Зарегистрированы

и внедрены наборы ПЦР

реагентов: для

качественного определения ДНК всех видов малярийных плазмодиев и дифференциации

ДНК возбудителей тропической и трехдневной малярии; для выявления и

количественного определения РНК SARS

-CoV-

2 в биологическом материале и в

объектах окружающей среды; для качественного определения РНК SARS

-CoV-

2 в

биологическом материале; для выявления мутации N501Y

SARS-CoV-

2; для

количественного определения ДНК вируса герпеса человека 7 типа в биологическом

материале; для качественного определения РНК энтеровирусов человека

289

видов/кластеров А, В, С, D, без дифференцировки между ними, в биологическом

материале и объектах окружающей среды; для выявления возбудителей вирусных

кишечных инфекций для качественного определения и дифференциации РНК

ротавирусов группы А, норовирусов 1 и 2 геногруппы, астровирусов и ДНК

аденовирусов группы F в биологическом материале и объектах

окружающей среды; для

выявления и внутривидовой дифференциации штаммов чумного микроба в формате

биочипа; для идентификации

V. cholerae

V. parahaemolyticus

Иммунобиологические диагностические препараты на различных стадиях

испытаний.

Подготовлена

научно

техническая документация на наборы ПЦР

реагентов:

для качественного определения полиморфизма 455 G>A в гене FGB (связан с

повышенным риском образования тромбов) в биологическом материале; для

качественного определения генотипов по полиморфизму 5G/4G rs1799762 в гене

SERPINE1 (связан с повышенным риском тромбоэмболии) в биологическом материале

человека; для выявления РНК вируса клещевого энцефалита, возбудителей иксодовых

клещевых боррелиозов, моноцитарного эрлихиоза человека, гранулоцитарного

анаплазмоза человека в клещах, крови, ликворе, аутоптатах; для качественного

определения ДНК

Helicobacter pylori

в биологическом материале; для выявления ДНК

Candida albicans

; для одновременного выявления и количественного определения ДНК

грибов рода

Candida

C. albicans

C. glabrata

C. krusei

C. parapsilosis

C. tropicalis

; для

определения генотипов вируса Западного Нила; на производство и применение

латексных тест

систем для быстрой идентификации

Yersinia enterocolitica

Yersinia

pseudotuberculosis

Проведены испытания набора ПЦР реагентов для генотипирования штаммов

возбудителя сапа

Burkholderia mallei

питательной среды «Аргининжелезо

сахарозный

агар», для дифференциации холерного вибриона от других микроорганизмов.

Научно-методическое обеспечение диагностики и

профилактики паразитарных заболеваний

Для ландшафтных зон юга Западной Сибири установлены виды потенциальных

переносчиков возбудителей дирофиляриоза (для северной лесной зоны

–

комары группы

communis р.

Ochlerotatus

, для южной степной и лесостепной зон

–

комары 9 видов,

относяшиеся к родам

Aedes

Ochlerotatus

Culex

Anopheles

). Установлен гипотетический

период риска передачи возбудителя дирофиляриоза позвоночному хозяину в

климатических условиях Омской области, составляющий 24

–

30 дней в период с июля

до

начала сентября.

На Дальнем Востоке России описан самостоятельный вид легочного сосальщика

Paragonimus westermani

генетически отличный от

Paragonimus icstermani

P. westermani

обнаружена специфичность в распределении нуклеотидного

разнообразия в последовательностях гена 28S рРНК, спейсера ITS2, статистически

значимая дифференциация и глубокий филогенетический разрыв между сестринскими

видами

Paragonimus

из Южной и Юго

Восточной Азии при морфологическом сходстве

червей.

Установлены морфологические особенности и принадлежность собранных с

морских котиков эктопаразитов к новому виду

–

Antarctophthirus nevelskoyi

n.sp.

Проведен эколого

паразитологический анализ функционирования природных

очагов описторхоза Западной Сибири, показано их стабильное функционирование в

регионе. Определены показатели зараженности рыб семейства карповых (

Cyprinidae

которые можно использовать для оценки лоймопотенциала и пространственной

структуры очага: зараженность метацеркариями паразита сеголеток, не совершающих

миграции, указывает на наличие всех звеньев паразитарной системы в исследуемом

биотопе, инвазированность рыб разных возрастных групп является критерием для

290

оценки напряженности очага описторхоза и определения эндемичности территории

исследования.

Подготовлен Кадастр очагов эхинококкоза в Дальневосточном федеральном

округе. Показано наличие синантропных, природных, смешанных очагов эхинококкозов.

Генетические и протеомные исследования описторхид и их первых

промежуточных хозяев дают возможность проанализировать возможные взаимосвязи

метаболических путей и механизмов иммунных взаимодействий хозяина и паразита и

предположить возможные общие звенья в ферментной и иммунной регуляции, которые

могут объединять все звенья паразитарной системы и участвовать в патогенезе инвазии

не только у промежуточных, но и у окончательных хозяев

отражаться на течении

инвазионной болезни у людей.

Разработка препаратов для специфической профилактики

и лечения инфекционных болезней

Испытания и регистрация препаратов для специфической профилактики

и лечения инфекционных болезней.

Зарегистрирована вакцина для профилактики

COVID-19 –

«ЭпиВакКорона

Н».

Проведены II

III фазы клинического исследования живой вакцины против

натуральной оспы и других ортопоксвирусных инфекций на основе аттенуированного

штамма ЛИВП ВОВ с шестью последовательно нарушенными генами вирулентности.

Завершена I фаза клинического исследования препарата НИОХ

14 для лечения

натуральной оспы и поствакцинальных осложнений.

Пересмотрена нормативная, эксплуатационная, техническая документация на

лекарственный препарат «Иммуноглобулин антирабический из сыворотки крови лошади

жидкий» и на лекарственный препарат «Вакцина холерная бивалентная химическая».

Разработано и зарегистрировано в установленном законодательством порядке

дезинфицирующее средство, на основе листериозных бактериофагов

Листфаг

»,

предназначенное для обработки объектов ветеринарного надзора и профилактики

инфекционных болезней животных.

Разработка препаратов для специфической профилактики и лечения

инфекционных болезней

. Разработана

нормативная документация на «Ферментативный

гидролизат фибрина сухой», обосновано его использование в качестве основы

питательной среды для накопления бактериальной массы Francisella tularensis 15 НИИЭГ

при получении лабораторных

серий «Вакцины туляремийной живой».

Получены штаммы

продуценты фрагмента RBD S белка SARS

-CoV-

2, а также

рекомбинантных белков VP1, VP2 и VP3 эховируса EСНО30. Полученные белки и

кодирующие их генетические конструкции являются заделом для создания и контроля

прототипов вакцин, включающих химерные белки вирусоподобных частиц.

Исследовано действие прототипов вакцин на основе вирусоподобных частиц

(ВПЧ) из белка VP1 норовируса на дендритные клетки человека в моделях иммунных

реакций

in vitro

. Результаты продемонстрировали возможность создания не только

норовирусной вакцины, но и более сложных конструкций с использованием

иммуностимулирующих свойств ВПЧ норовируса. Примером таких конструкций могут

быть химерные белки на основе S

домена VP1 норовируса и наружных доменов белков

других вирусов, включая SARS

-CoV-2.

Установлена способность нативного фукоидана из бурой водоросли Fucus

evanescens и его высокомолекулярных и низкомолекулярных фракций ингибировать

различные стадии жизненного цикла ортохантавирусов в клетках Vero. Основной

компонент фракции низкомолекулярного фкукоидана 2O

сульфатированный

фукотетрасахарид связывается с гликопротеинами вирусной оболочки Gn/Gc, и с

клеточным интегрином β3, предотвращая взаимодействие вируса с клеткой, что

Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2021 году» - часть 18